慈禧身后20年，即1928年7月4日至10日。军阀孙殿英盗掘了乾隆帝的裕陵和慈禧陵，毁棺抛尸，掠走了全数随葬瑰宝。慈禧尸体被抛出棺外，嘴里的宝珠被抠走，上衣也被扒光了，下体仅剩一条内裤。

　　盗案产生后，溥仪派载泽、耆龄、宝熙等人到东陵对慈禧的尸体进行了从新埋葬。载泽等人钻进地宫，见慈禧尸体趴在棺盖上，头朝北，脚朝南，左手反搭在背面上。在地宫里已暴尸40多天，尸体上呈现了很多黑点，长满了白毛。

　　载泽等人见内棺尚齐备，可以继承使用，因而命旗妇用一块黄绸子将慈禧尸体盖上，将一件黄缎褥铺在尸体一侧，然后渐渐翻转尸体，恰好将尸体仰卧在黄缎褥上。只见慈禧面色灰白，两眼深陷无珠，颧骨高隆，嘴唇有伤痕。世人帮扶着，用如意板将慈禧尸体抬入棺内，如意板未撤出。尸体上盖上一件黄缎被，把从地宫里十到的慈禧生前剪下的指甲和掉的牙用黄绸子包好，放在被上。载泽又将昔时获得的慈禧遗物——一件黄缎袍、一件坎肩盖在被上，盖上棺盖，用漆封上棺口，重殓终了。

　　第三次入棺：1984年文物局清算内棺搬出尸身

　　1979年2月17日，清东陵文物保管所对慈禧地宫进行了清算。由于要赶在五一节关闭慈禧地宫和慈安陵高空修建，保管所带领决议将慈禧内棺留到游览旺季再清算。

　　1983年12月初，游览已进入旺季。保管所带领决议清算慈禧内棺。12月6日，清算小组关上棺盖后，看到一件黄缎大被把棺内盖得结结实实，被上盖着两件衣服。很明显，这是1928年载泽等人重殓时的原状，55年来不停没人动过。为安妥起见，保管所带领决议先盖上棺盖，封锁地宫，将此事向下级报告请示。

　　1984年1月4日，国家文物局派来了几名专家，与清东陵文物保管所构成了一个清算慈禧内棺10人小组。

　　次日，清算小组挨次揭取了被上的两件衣服，发明了包着慈禧指甲和牙齿的小黄包。当将黄缎卷走后，慈禧的遗骸显现在眼前，她的面部及下身用黄绸包裹着，上身穿戴裤子，裤子上绣满了“寿”字，一只脚上穿戴袜子。尸体仰身直卧着，头轻轻左偏，右手放在腹部，左臂自然地垂于身材左边，两眼深陷成洞，腰间扎着一条丝带。尸体还是完整一体的，全长153厘米。

　　慈禧生前照

　　清算小组用她身底下的如意板将尸体从棺中抬出，放在地宫的高空上。在棺内喷洒了防腐消毒药液后，又将慈禧的尸体抬入棺内。这是她身后第三次被抬入这口棺中。然后将被、小黄包及两件衣服彻底按原样、原地位放回。一切都规复了原状后，又往棺内喷洒了一遍药液，盖上棺盖，封好棺盖口，木匠们将残缺的外椁修睦后，套在了棺外。